Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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FAM27BQ5VT28 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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FAM27BQ5VT28 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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FAM27BQ5VT28 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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FAM27BQ5VT28 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27BQ5VT28 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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