Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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