Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms