Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BOLA3Q53S33 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms