Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 LINC00365-201ENST00000413591 2618 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NFIB-206ENST00000397575 2869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 M1AP-202ENST00000409585 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 C1orf220-202ENST00000521244 2577 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 LOXL2-201ENST00000389131 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 C1orf27-203ENST00000419367 1900 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms