Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms