Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms