Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GRIK4Q16099 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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