Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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