Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CACNA1G-204ENST00000359106 7648 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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