Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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