Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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NCOA1Q15788 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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NCOA1Q15788 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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NCOA1Q15788 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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NCOA1Q15788 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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NCOA1Q15788 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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