Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TAF13Q15543 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TAF13Q15543 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TAF13Q15543 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TAF13Q15543 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TAF13Q15543 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TAF13Q15543 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TAF13Q15543 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TAF13Q15543 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TAF13Q15543 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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