Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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