Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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COL19A1Q14993 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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