Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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