Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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