Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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