Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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