Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF5Q13568 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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