Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 HEXB-205ENST00000509579 806 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 OR13Z2P-201ENST00000606338 555 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms