Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RLFQ13129 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RLFQ13129 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RLFQ13129 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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