Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CHAF1BQ13112 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CHAF1BQ13112 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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CHAF1BQ13112 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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