Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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