Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FOXD4Q12950 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FOXD4Q12950 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FOXD4Q12950 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FOXD4Q12950 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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FOXD4Q12950 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FOXD4Q12950 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FOXD4Q12950 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD4Q12950 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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