Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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