Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms