Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms