Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms