Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNB3Q05901 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms