Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSBP1Q04837 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms