Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms