Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms