Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms