Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms