Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms