Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MDM2Q00987 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms