Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms