Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX1P83916 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX1P83916 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms