Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL8P80075 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CCL8P80075 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL8P80075 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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