Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERVS71-1P61550 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms