Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVFC1-1P60608 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms