Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms