Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HK3P52790 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HK3P52790 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HK3P52790 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HK3P52790 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HK3P52790 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms