Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI2P48788 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms