Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLCP48506 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLCP48506 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLCP48506 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLCP48506 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLCP48506 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLCP48506 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLCP48506 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLCP48506 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLCP48506 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms