Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ME1P48163 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ME1P48163 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ME1P48163 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms