Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAGEA4P43358 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms