Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV4P43268 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV4P43268 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV4P43268 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV4P43268 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV4P43268 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV4P43268 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV4P43268 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV4P43268 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV4P43268 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV4P43268 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV4P43268 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV4P43268 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV4P43268 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV4P43268 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV4P43268 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ETV4P43268 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ETV4P43268 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ETV4P43268 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV4P43268 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms