Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC19A1P41440 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC19A1P41440 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms